Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC89Q8N998 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC89Q8N998 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms