Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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