Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED8Q8IZ13 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED8Q8IZ13 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms