Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF3Q86WH2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASSF3Q86WH2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms