Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB4Q86W47 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB4Q86W47 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms