Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC6BQ86SZ2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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