Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLNKQ7Z7G1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLNKQ7Z7G1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms