Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX7Q7RTT5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms