Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP2Q7RTS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOP2Q7RTS6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms