Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMIM5Q71RC9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM5Q71RC9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms