Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms