Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSMFQ6X4W1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMFQ6X4W1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms