Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXD4L3Q6VB84 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms