Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCBE1Q6UXH8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCBE1Q6UXH8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms