Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1Q6PKG0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms