Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC137Q6PK04 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms