Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AGAP6Q5VW22 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AGAP6Q5VW22 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP6Q5VW22 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AGAP6Q5VW22 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms