Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01545Q5VT33 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01545Q5VT33 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms