Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HES3Q5TGS1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HES3Q5TGS1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms