Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD5Q5TGI4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms