Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMEM201Q5SNT2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM201Q5SNT2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms