Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC27A3Q5K4L6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC27A3Q5K4L6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms