Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD3Q5JV73 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMPD3Q5JV73 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms