Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB41Q5JT25 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB41Q5JT25 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms