Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FGD3Q5JSP0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FGD3Q5JSP0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms