Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM41BQ5BJD5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM41BQ5BJD5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM41BQ5BJD5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM41BQ5BJD5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM41BQ5BJD5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM41BQ5BJD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms