Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP29Q52LW3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms