Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC38Q502W7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC38Q502W7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms