Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP20-1Q3LI63 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms