Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RTN1Q16799 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTN1Q16799 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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