Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 DDX5-208ENST00000578491 463 ntTSL 26.7□□□□□ -1.344e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.534e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 DDX5-212ENST00000579461 814 ntTSL 35.06□□□□□ -1.64e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 DDX5-234ENST00000585317 923 ntTSL 23.85□□□□□ -1.794e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 49.56□□□□□ -0.884e-7■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.676e-9■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.251e-8■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 EPS8L2-220ENST00000531393 2304 ntTSL 1 (best)16.22■□□□□ 0.191e-8■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 EPS8L2-212ENST00000528770 2233 ntTSL 215.47■□□□□ 0.071e-8■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 EPS8L2-202ENST00000524474 907 ntTSL 215.29■□□□□ 0.041e-8■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 01e-8■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 EPS8L2-217ENST00000530452 704 ntTSL 314.16□□□□□ -0.141e-8■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 EPS8L2-207ENST00000526651 572 ntTSL 413.64□□□□□ -0.231e-8■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-8■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-8■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31e-8■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-8■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 EPS8L2-208ENST00000526909 3844 ntTSL 510.59□□□□□ -0.711e-8■□□□□ 9.7
SRSF7Q16629 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.45e-6■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 HNRNPH1-218ENST00000510678 1996 ntTSL 511.65□□□□□ -0.545e-6■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.575e-6■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 HNRNPH1-236ENST00000519958 885 ntTSL 59.59□□□□□ -0.875e-6■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.466e-7■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 CCNL1-226ENST00000631619 2457 ntTSL 515.26■□□□□ 0.036e-7■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.336e-7■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 CCNL1-212ENST00000470121 1889 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.516e-7■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 CCNL1-217ENST00000476367 1603 ntTSL 1 (best)11.69□□□□□ -0.546e-7■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 CCNL1-219ENST00000477127 1464 ntTSL 511.62□□□□□ -0.556e-7■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 CCNL1-216ENST00000475298 2362 ntTSL 1 (best)10.86□□□□□ -0.676e-7■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.576e-11■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 HNRNPM-209ENST00000597813 630 ntTSL 215.58■□□□□ 0.086e-11■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.086e-11■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 515.26■□□□□ 0.036e-11■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.046e-11■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 514.7□□□□□ -0.066e-11■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 214.55□□□□□ -0.086e-11■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 HNRNPM-206ENST00000596984 664 ntTSL 514.55□□□□□ -0.086e-11■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 HNRNPM-215ENST00000601645 832 ntTSL 311.86□□□□□ -0.516e-11■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-15■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 METAP2-211ENST00000553151 564 ntTSL 513.43□□□□□ -0.267e-8■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 213.36□□□□□ -0.277e-8■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.537e-8■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.717e-8■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.727e-8■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.037e-8■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.217e-8■□□□□ 9.6
SRSF7Q16629 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.062e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.992e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.942e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.942e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.862e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.832e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.752e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 SDR39U1-221ENST00000556707 1196 ntTSL 219.71■□□□□ 0.755e-13■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-211ENST00000567444 635 ntTSL 217.36■□□□□ 0.372e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 SDR39U1-204ENST00000553343 681 ntTSL 216.92■□□□□ 0.35e-13■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.262e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.182e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.122e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.075e-13■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 SDR39U1-210ENST00000555225 769 ntTSL 315.29■□□□□ 0.045e-13■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-207ENST00000563012 646 ntTSL 315.25■□□□□ 0.032e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.062e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-209ENST00000565777 1313 ntTSL 213.67□□□□□ -0.222e-7■□□□□ 9.5
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SRSF7Q16629 SDR39U1-217ENST00000556249 556 ntTSL 312.82□□□□□ -0.365e-13■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-204ENST00000561855 672 ntTSL 512.38□□□□□ -0.432e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-213ENST00000568411 599 ntTSL 311.95□□□□□ -0.52e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 SDR39U1-211ENST00000555355 934 ntTSL 211.25□□□□□ -0.615e-13■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 SDR39U1-214ENST00000555778 608 ntTSL 210.58□□□□□ -0.725e-13■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MAZ-206ENST00000562557 475 ntTSL 39.93□□□□□ -0.822e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MSI2-209ENST00000579483 5141 ntTSL 1 (best)8.51□□□□□ -1.052e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MSI2-219ENST00000584476 465 ntTSL 34.86□□□□□ -1.632e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MSI2-214ENST00000581776 493 ntTSL 24.42□□□□□ -1.72e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MSI2-212ENST00000579590 452 ntTSL 54.02□□□□□ -1.772e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MSI2-211ENST00000579531 472 ntTSL 23.96□□□□□ -1.782e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 MSI2-213ENST00000581523 534 ntTSL 23.9□□□□□ -1.792e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.234e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.884e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.774e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.384e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.384e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 RBM28-204ENST00000478061 932 ntTSL 310.35□□□□□ -0.755e-9■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 RBM28-202ENST00000415472 2251 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.825e-9■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 RBM28-206ENST00000487602 715 ntTSL 56.67□□□□□ -1.345e-9■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 SH3GL1-204ENST00000598219 619 ntTSL 36.34□□□□□ -1.394e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.475e-9■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 RBM28-207ENST00000488249 570 ntTSL 33.67□□□□□ -1.825e-9■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.041e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.091e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.711e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.711e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.411e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.591e-7■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 FKBP10-207ENST00000490938 837 ntTSL 212.41□□□□□ -0.423e-23■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.244e-9■□□□□ 9.5
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