Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNXAQ16473 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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