Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS72Q15906 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
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