Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIP13Q15645 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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