Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKX1-1Q15270 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NKX1-1Q15270 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms