Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NECTIN1Q15223 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NECTIN1Q15223 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NECTIN1Q15223 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
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