Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAPTM4AQ15012 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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