Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53BQ14153 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53BQ14153 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53BQ14153 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53BQ14153 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53BQ14153 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53BQ14153 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53BQ14153 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53BQ14153 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53BQ14153 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM53BQ14153 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM53BQ14153 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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