Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK13Q14004 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDK13Q14004 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK13Q14004 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
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