Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCINQ13939 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCINQ13939 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCINQ13939 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCINQ13939 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCINQ13939 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCINQ13939 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCINQ13939 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCINQ13939 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCINQ13939 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCINQ13939 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCINQ13939 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCINQ13939 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCINQ13939 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCINQ13939 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCINQ13939 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCINQ13939 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCINQ13939 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCINQ13939 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCINQ13939 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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