Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
PTCH1Q13635 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PTCH1Q13635 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
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