Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTM1Q13496 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTM1Q13496 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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