Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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