Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOP3AQ13472 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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