Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN4PQ13434 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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