Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3B2Q13367 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3B2Q13367 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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