Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN3Q13286 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN3Q13286 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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