Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD300CQ08708 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms