Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX9Q08211 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 639.7 ms