Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX4Q06945 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms